Las cucarachas pueden adquirir, transportar y transmitir diversos patógenos, utilizando como vehículo las estructuras Bucales, sedas, ornamentaciones, alas, patas u otras estructuras corporales así como sus propias regurgitaciones y materia fecal. Se han aislado al menos 100 especies de bacterias a partir de ejemplares colectados en casas, escuelas, restaurantes, hospitales y tiendas de animales. Frecuentemente se encuentran virus y diversas especies de hongos, protozoarios y helmintos. Todos estos patógenos son causantes de enfermedades tan comunes como disentería, diarrea infantil, gastroenteritis, salmonelosis, fiebre tifoidea, difteria, tuberculosis, teniasis, ascariasis y muchas más.
Debido a lo anterior representan un serio riesgo a la salud humana y de otras especies animales.
Como por ejemplo, se ha documentado que los patógenos causantes de la tuberculosis pueden permanecer hasta 8 semanas en la materia fecal del género Blatta orientalis,que se encontraron
alimentándose de desechos de hospitales. Esta materia fecal pudo ser depositada por las mismas cucarachas en el alimento de los pacientes.
Por otro lado, esta documentado que hasta el 60% de las cucarachas colectadas en una granja de aves, se encontraban infectadas con acantocéfalos (parásitos ),situación que estaba directamente relacionada con la elevada mortalidad de aves observada en la granja. El problema solo pudo ser controlado mediante la reducción de la población de cucarachas con insecticidas de amplio espectro, rotación de varios ingredientes activos, y el uso de métodos de aplicación que hacen más efectivo este tipo de control.
Además de su papel como vectores de diversos patógenos, se ha informado que especies como Periplaneta americana o Leocophaea maderae excretan diversos ácidos derivados del triptófano lo que, hipotéticamente, podría ocasionar daños a la salud por tratarse de compuestos mutagénicos o carcinogénicos.
Aunque con poca frecuencia, las cucarachas pueden ocasionar daños directos a la salud, habiéndose documentado algunos casos de irritaciones en la piel ocasionadas por secreciones como saliva o ceras cuniculares. También se conocen casos de infecciones ocasionadas por la entrada de cucarachas al canal auditivo.
Cuando las poblaciones de cucarachas llegan a ser abundantes, las cutículas producidas durante el desarrollo de los estadios ninfales son transportadas por el viento y fragmentados, produciéndose un polvo muy fino que al ser inhalado puede ocasionar reacciones alérgicas a nivel respiratorio, o puede potencializar la alergia ocasionada por los ácaros del polvo.